Lorsque le générateur d'ozone reçoit l'ordre de mise en route, la vanne d'entrée s'ouvre laissant entrer l'oxygène dans l'équipement. Le manoréducteur d'entrée maintient le rang de pression d'oxygène désiré. Une fois la pression régulée, l'oxygène est conduit vers la virole de génération d'ozone où il est soumis à un fort champ électrique dissociant la molécule de dioxygène en atomes libres. Ces atomes se recombinent de 3 en 3 créeant la molécule d'ozone O3, un gaz très oxydant et réactif. Le débitmètre de gaz mesure continuellement le débit d'ozone et s'ajuste au débit désiré grâce à la vanne proporcionnelle. La puissance en kW de l'équipement peut être varier à l'écran de manière manuelle ou bien via un signal 4-20 mA externe.

S'il ne détecte pas le débit d'eau, le débit d'oxygène ou si la température de réfrigération n'est pas adéquate, le générateur émettra une alarme et s'arrêtera par sécurité.